Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NeflP08551 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NeflP08551 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NeflP08551 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NeflP08551 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NeflP08551 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NeflP08551 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NeflP08551 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NeflP08551 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NeflP08551 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NeflP08551 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NeflP08551 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NeflP08551 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NeflP08551 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NeflP08551 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NeflP08551 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NeflP08551 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
NeflP08551 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NeflP08551 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NeflP08551 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NeflP08551 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NeflP08551 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NeflP08551 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NeflP08551 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NeflP08551 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NeflP08551 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NeflP08551 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NeflP08551 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NeflP08551 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NeflP08551 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NeflP08551 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NeflP08551 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NeflP08551 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NeflP08551 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NeflP08551 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NeflP08551 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NeflP08551 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NeflP08551 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NeflP08551 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NeflP08551 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NeflP08551 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NeflP08551 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NeflP08551 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NeflP08551 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NeflP08551 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NeflP08551 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NeflP08551 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NeflP08551 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NeflP08551 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NeflP08551 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NeflP08551 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NeflP08551 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NeflP08551 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NeflP08551 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NeflP08551 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NeflP08551 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NeflP08551 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NeflP08551 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NeflP08551 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NeflP08551 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NeflP08551 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NeflP08551 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NeflP08551 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NeflP08551 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NeflP08551 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NeflP08551 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NeflP08551 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NeflP08551 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NeflP08551 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NeflP08551 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NeflP08551 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NeflP08551 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NeflP08551 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NeflP08551 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NeflP08551 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NeflP08551 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NeflP08551 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NeflP08551 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NeflP08551 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NeflP08551 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NeflP08551 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NeflP08551 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NeflP08551 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NeflP08551 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NeflP08551 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NeflP08551 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NeflP08551 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NeflP08551 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms