Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna4P07351 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna4P07351 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms