Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ifna6P07350 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ifna6P07350 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ifna6P07350 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms