Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf1P07141 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Csf1P07141 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf1P07141 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf1P07141 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Csf1P07141 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms