Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Apoa4P06728 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa4P06728 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa4P06728 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa4P06728 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa4P06728 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa4P06728 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Apoa4P06728 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Apoa4P06728 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Apoa4P06728 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms