Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Saa1P05366 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa1P05366 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa1P05366 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa1P05366 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa1P05366 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Saa1P05366 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Saa1P05366 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms