Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Hoxa7P02830 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxa7P02830 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Hoxa7P02830 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms