Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
H2-K1P01901 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
H2-K1P01901 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms