Protein–RNA interactions for Protein: P01801

Ig heavy chain V-III region J606, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01801 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01801 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01801 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01801 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01801 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01801 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01801 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01801 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01801 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01801 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01801 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01801 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01801 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01801 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01801 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01801 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01801 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms