Protein–RNA interactions for Protein: P01660

Ig kappa chain V-III region PC 3741/TEPC 111, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01660 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01660 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01660 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01660 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01660 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01660 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01660 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01660 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01660 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01660 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P01660 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01660 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01660 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01660 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01660 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01660 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01660 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01660 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01660 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01660 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01660 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01660 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01660 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01660 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01660 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01660 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01660 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01660 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01660 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01660 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01660 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01660 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01660 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01660 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01660 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01660 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01660 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01660 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01660 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01660 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01660 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01660 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01660 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01660 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01660 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01660 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01660 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01660 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01660 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01660 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01660 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01660 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01660 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01660 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01660 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01660 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01660 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01660 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01660 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01660 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01660 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01660 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms