Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01658 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01658 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01658 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01658 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01658 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01658 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01658 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01658 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01658 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01658 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01658 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01658 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01658 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01658 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01658 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01658 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01658 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01658 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01658 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01658 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01658 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01658 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01658 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01658 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01658 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01658 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01658 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01658 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01658 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01658 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01658 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01658 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01658 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01658 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01658 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01658 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01658 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms