Protein–RNA interactions for Protein: P01572

Ifna1, Interferon alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna1P01572 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ifna1P01572 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ifna1P01572 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms