Protein–RNA interactions for Protein: P00740

F9, Coagulation factor IX, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F9P00740 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
F9P00740 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F9P00740 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
F9P00740 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
F9P00740 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
F9P00740 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F9P00740 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F9P00740 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
F9P00740 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
F9P00740 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
F9P00740 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F9P00740 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F9P00740 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F9P00740 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F9P00740 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F9P00740 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
F9P00740 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F9P00740 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
F9P00740 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F9P00740 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F9P00740 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F9P00740 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F9P00740 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F9P00740 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F9P00740 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F9P00740 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F9P00740 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F9P00740 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
F9P00740 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F9P00740 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F9P00740 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F9P00740 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
F9P00740 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F9P00740 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F9P00740 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F9P00740 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F9P00740 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F9P00740 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F9P00740 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F9P00740 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F9P00740 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F9P00740 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
F9P00740 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
F9P00740 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
F9P00740 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F9P00740 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F9P00740 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F9P00740 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
F9P00740 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
F9P00740 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F9P00740 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F9P00740 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F9P00740 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F9P00740 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F9P00740 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F9P00740 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F9P00740 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F9P00740 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F9P00740 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms