Protein–RNA interactions for Protein: P00405

Mtco2, Cytochrome c oxidase subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtco2P00405 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Mtco2P00405 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Mtco2P00405 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms