Protein–RNA interactions for Protein: O88676

Mmp23, Matrix metalloproteinase-23, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp23O88676 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Mmp23O88676 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Mmp23O88676 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Mmp23O88676 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Mmp23O88676 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Mmp23O88676 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mmp23O88676 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Mmp23O88676 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mmp23O88676 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mmp23O88676 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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