Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Dnmt3bO88509 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Dnmt3bO88509 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms