Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChkbO55229 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChkbO55229 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ChkbO55229 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ChkbO55229 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ChkbO55229 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChkbO55229 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ChkbO55229 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms