Protein–RNA interactions for Protein: O55087

Mef2b, Myocyte-specific enhancer factor 2B, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mef2bO55087 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Mef2bO55087 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Mef2bO55087 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms