Protein–RNA interactions for Protein: O55003

Bnip3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip3O55003 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Bnip3O55003 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnip3O55003 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnip3O55003 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms