Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cavin1O54724 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cavin1O54724 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms