Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emp3O35912 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Emp3O35912 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Emp3O35912 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emp3O35912 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emp3O35912 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Emp3O35912 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emp3O35912 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emp3O35912 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Emp3O35912 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms