Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppfibp2O35711 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ppfibp2O35711 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ppfibp2O35711 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms