Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Abcc1O35379 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Abcc1O35379 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC30.26■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Abcc1O35379 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms