Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Slc18a3O35304 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc18a3O35304 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms