Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc23O35125 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc23O35125 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc23O35125 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc23O35125 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc23O35125 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Lrrc23O35125 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrrc23O35125 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Lrrc23O35125 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Lrrc23O35125 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc23O35125 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc23O35125 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc23O35125 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc23O35125 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc23O35125 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc23O35125 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc23O35125 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc23O35125 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Lrrc23O35125 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms