Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif1cO35071 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif1cO35071 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif1cO35071 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif1cO35071 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif1cO35071 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif1cO35071 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif1cO35071 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif1cO35071 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif1cO35071 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kif1cO35071 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kif1cO35071 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Kif1cO35071 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kif1cO35071 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms