Protein–RNA interactions for Protein: O35054

Cldn4, Claudin-4, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn4O35054 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Cldn4O35054 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Cldn4O35054 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cldn4O35054 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
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