Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm379J3QQ19 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Gm379J3QQ19 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
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Gm379J3QQ19 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gm379J3QQ19 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
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Gm379J3QQ19 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm379J3QQ19 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
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Gm379J3QQ19 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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