Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 AC154646.1-201ENSMUST00000225011 1092 ntBASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.34□□□□□ -0.91
Gm21887J3QQ04 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Olfr23-202ENSMUST00000214210 2527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm8185-201ENSMUST00000160999 669 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm38134-201ENSMUST00000191858 1234 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm11569-201ENSMUST00000105057 869 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm14435-201ENSMUST00000108995 643 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm11652-201ENSMUST00000117842 1267 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm15579-201ENSMUST00000141299 757 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Gm21887J3QQ04 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms