Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm5849J3QPE5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm5849J3QPE5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms