Protein–RNA interactions for Protein: J3QN01

Ms4a18, Membrane-spanning 4-domains, subfamily A, member 18, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a18J3QN01 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ms4a18J3QN01 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ms4a18J3QN01 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a18J3QN01 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ms4a18J3QN01 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Ms4a18J3QN01 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a18J3QN01 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ms4a18J3QN01 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ms4a18J3QN01 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Ms4a18J3QN01 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Ms4a18J3QN01 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Ms4a18J3QN01 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ms4a18J3QN01 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms