Protein–RNA interactions for Protein: J3KMP5

Gm21897, Predicted gene, 21897, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21897J3KMP5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21897J3KMP5 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21897J3KMP5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21897J3KMP5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21897J3KMP5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21897J3KMP5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm21897J3KMP5 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm21897J3KMP5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm21897J3KMP5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms