Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn20G5E8X0 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Cldn20G5E8X0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Cldn20G5E8X0 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cldn20G5E8X0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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