Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tmigd3G3X8R9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tmigd3G3X8R9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tmigd3G3X8R9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms