Protein–RNA interactions for Protein: G3UW71

Vmn1r167, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r167G3UW71 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vmn1r167G3UW71 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Vmn1r167G3UW71 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms