Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ScaperF8VQ70 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ScaperF8VQ70 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms