Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC35.77■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
BicraF8VPZ9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.76■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.76■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.73■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC35.73■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC35.72■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.72■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
BicraF8VPZ9 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
BicraF8VPZ9 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms