Protein–RNA interactions for Protein: F8VPP0

Zfp708, Zinc finger protein 708, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp708F8VPP0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Zfp708F8VPP0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Zfp708F8VPP0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms