Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sptbn5F6UCX4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sptbn5F6UCX4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sptbn5F6UCX4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms