Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdhr2E9Q7P9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdhr2E9Q7P9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdhr2E9Q7P9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms