Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
DspE9Q557 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
DspE9Q557 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DspE9Q557 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
DspE9Q557 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DspE9Q557 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
DspE9Q557 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DspE9Q557 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DspE9Q557 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DspE9Q557 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms