Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4V7

Gm17727, Predicted gene, 17727, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17727E9Q4V7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm17727E9Q4V7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm17727E9Q4V7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm17727E9Q4V7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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