Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pdzd2E9Q1M1 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pdzd2E9Q1M1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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