Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Vmn1r68E9Q0V3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn1r68E9Q0V3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r68E9Q0V3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms