Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm9972E9Q053 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm9972E9Q053 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms