Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Srp54bE9PXC0 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Srp54bE9PXC0 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms