Protein–RNA interactions for Protein: E9PWL0

Trim30d, Tripartite motif-containing 30D, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30dE9PWL0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30dE9PWL0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trim30dE9PWL0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Trim30dE9PWL0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms