Protein–RNA interactions for Protein: E9PUQ3

AU019823, Expressed sequence AU019823, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU019823E9PUQ3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
AU019823E9PUQ3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
AU019823E9PUQ3 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms