Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ccnb1ip1D3Z3K2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms