Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SafbD3YXK2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SafbD3YXK2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SafbD3YXK2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SafbD3YXK2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SafbD3YXK2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SafbD3YXK2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SafbD3YXK2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SafbD3YXK2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138 ms